Louise Mushikiwabo sinh ngày 22 tháng 05 năm 1961 tại Kigali, thủ đô của Rwandan.[3] Cha cô là Bitsindinkumi, một người Tutsi từ tộc Batsobe; [4] Bitsindinkumi làm nông dân, quản lý các công việc nhỏ của gia đình cũng như làm kế toán cho một đồn điền cà phê thuộc địa.[4] Mẹ cô là Nyiratulira, [4] Cô trải qua thời thơ ấu ở Kigali.[5] Cô là em út trong số 09 người con,[6] anh chị em của cô bao gồm Lando Ndasingwa, người đã trở thành một doanh nhân và chính trị gia đáng chú ý ở Rwanda trước khi bị giết năm 1994 trong cuộc diệt chủng Rwandan,[5] và Anne-Marie Kantengwa, người đã tiếp quản khách sạn Lando, ông Land Land sau khi ông qua đời và phục vụ tại Quốc hội Rwanda từ năm 2003 đến năm 2008 [7]

Sau khi hoàn thành học chương trình tiểu học và trung học ở Kigali, Mushikiwabo, kế đến đi học tại Đại học Quốc gia Rwanda (hiện là Đại học Rwanda), ở thành phố phía nam Butare, năm 1981.[3] Cô tốt nghiệp đại học năm 1984, với bằng cử nhân tiếng Anh, và sau đó làm việc một thời gian ngắn với tư cách là một giáo viên trung học.[3] Năm 1986, cô di cư từ Rwanda đến Hoa Kỳ,[8] nơi cô bắt đầu học thạc sĩ về Ngôn ngữ và Phiên dịch tại Đại học Delwar, với tiếng Pháp là ngôn ngữ chuyên ngành.[9] Sau khi học xong năm 1988,[9] cô ở lại Hoa Kỳ, định cư ở khu vực Washington, DC.[10] Cô bắt đầu sự nghiệp làm việc cho các tổ chức vận động hành lang, trước khi đảm nhận vị trí với Ngân hàng Phát triển Châu Phi (ADB); như một phần vai trò của cô với ADB, cô sống ở Tunisia trong một thời gian ngắn,[10] và cuối cùng trở thành Giám đốc Truyền thông của ngân hàng này.[6]

Vào năm 2006, Mushikiwabo đã viết một cuốn sách, với chủ đề Rwanda Means the Universe,[11] được đồng tác giả bởi Jack Kramer, một nhà báo người Mỹ và cựu sinh viên biển.[12] Cuốn sách là một cuốn tự truyện, mô tả lịch sử gia đình của Mushikiwabo, cuộc sống ban đầu của cô ở Rwanda và những trải nghiệm của cô khi di cư sang Hoa Kỳ.[11] Nó cũng mô tả chi tiết về cuộc diệt chủng Rwandan, từ góc độ lịch sử cũng như quan điểm sống của Mushikwabo khi sống ở Washington, khi cô nhận được tin rằng nhiều thành viên trong gia đình cô đã bị giết.[11]